تعیین تنوع ژنتیکی جمعیت گل خورک ماهی periophthalmus waltoniدر مناطق هندیجان وخورزنگی و دلوار با استفاده از روش مولکولی rapd
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر
- نویسنده سعاد یعش بجاری
- استاد راهنما مهدی محمدی سیداحمد قاسمی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1388
چکیده
به منظور مطالعه ژنتیکی جمعیت های گل خورک ماهیperiophthalmus waltoni در مناطق هندیجان و خورزنگی و دلوار با استفاده از روش مولکولی rapd، تعداد 69 نمونه گل خورک از گونه غالب موجود در منطقه (periophthalmus waltoni ) جمع آوری شد. مقداری از بافت باله جدا و پس از فیکس کردن در الکل اتانول 96 درصد به آزمایشگاه مرکز مطالعات خلیج فارس در دانشگاه خلیج فارس بوشهر منتقل شد. dna ژنومی نمونه ها به روش استات آمونیوم استخراج گردید و کمیت و کیفیت dna استخراجی با استفاده از روش اسپکتروفتومتر و الکتروفورز روی ژل آگارز 1 درصد و رنگ آمیزی توسط اتیدیوم بروماید مورد بررسی قرار گرفت. واکنش زنجیره ای پلیمراز ( pcr ) با استفاده از 6 پرایمر rapd صورت گرفت. محصولات تکثیر شده با استفاده از ژل پلی اکریل آمید 3% الکتروفورز و با نیترات نقره رنگ آمیزی شدند. و با استفاده از نرم افزار ژنتیکی genealex و popgene مقادیر مربوط به تنوع ژنتیکی، شاخص شانون، میزان شباهت، فاصله ژنتیکی بر اساس nei’s ( 1972 )، جریان ژنی و تنوع ژنتیکی بر اساس تست amova در سطح خطای 01/0 مورد محاسبه قرار گرفت. نتایج بدست آمده از این بررسی نشان داد که تعداد کل باند های تولید شده 59 باند می باشد که دامنه تعداد باندها بین 5تا 17 باند با میانگین11 باند برای هر پرایمر بدست آمد. درصد باندهای پلی مورفیسمی در جمعیت هندیجان.86.44 % بود در حالی که درصد باندهای پلی مورفیسم در منطقه خور زنگی 66.10/0و در منطقه دلوار74.58% بود و میانگین باندهای پلی مورفیسم در سه جمعیت 71/75 % می باشد. بر اساس داده های فراوانی آللی، مجموعا 9 آلل اختصاصی یافت شد که 5 تا از آن در نمونه های منطقه هندیجان و 3 تا از آن در منطقه دلوار و 1عدد در منطقه خورزنگی مشاهده شد. میانگین میزان تنوع ژنتیکی در جمعیت هندیجان2509/0 با انحراف معیار1668/0 می باشد. در حالیکه مقدار آن در منطقه خور زنگی1815/0 با انحراف معیار1745/0می باشد و .در منطقه دلوار2267 /0 با انحراف معیار1743/0می باشد. با استفاده از نرم افزار popgene میانگین شاخص اطلاعات شانون برای جمعیت هندیجان و خورزنگی و دلوار محاسبه شد که برای هندیجان برابر با 3887/0با انحراف معیار2313/0و برای منطقه خورزنگی برابر با 2860/0با انحراف معیار 2501/0و برای منطقه دلوار برابربا 3509/0با انحراف معیار 2480/0بود.در حالی که میانگین شاخص شانون محاسبه شده برای این سه جمعیت برابر با 4230/0 بود در این بررسی میزان gst بین جمعیت هندیجان و خور زنگی 260/0وبین هندیجان دلوار 204/0و بین جمعیت خور زنگی و دلوار 195/0می باشد. میزانnm بین جمعیت هندیجان و خورزنگی 687/0میزان آن بین جمعیت هندیجان و دلوار 974/0وبین خورزنگی ودلوار 033/1می باشد. ماتریس فواصل و شباهت ژنتیکی با استفاده از معیار فاصله ژنتیکی (1972) nei و بوسیله نرم افزارgene alex محاسبه شد که بر اساس این مشاهدات میزان شباهت ژنتیکی بین دو جمعیت هندیجان و خورزنگی 833/0 در حالیکه میزان شباهت بین هندیجان و دلوار 901/0 و میزان شباهت بین دلوار و خورزنگی 924/0 می باشد.میزان تفاوت ژنتیکی بین دو منطقه هندیجان و خورزنگی 125/0 و میزان تفاوت ژنتیکی بین هندیجان و دلوار 104/0 و میزان تفاوت بین دلوار و خورزنگی079/0می باشد. بر اساس تست amova و در سطح احتمال خطای 01/0 میزان تنوع ژنتیکی بین جمعیت ها و در داخل جمعیت ها مورد بررسی قرار گرفت که میزان تنوع و اختلاف ژنتیکی در سطح معنی داری 01/0 بین سه جمعیت هندیجان و خورزنگی و دلوار برابر با 26% و میزان تنوع و اختلاف در داخل جمعیتها در سطح معنی داری01 /0 برابر با 74 % بود. نتایج این بررسی نشان داد که سه جمعیت مورد بررسی از هم جدا و در واقع سه جمعیت مجزا و متعلق به دو کلاستر می باشند.
منابع مشابه
بررسی تنوع ژنتیکی ماهی گل خورک (Periophthalmus waltoni) با استفاده از نشانگر های RAPD در خلیج فارس
به منظور مطالعه ژنتیکی جمعیت های گل خورک ماهی Periophthalmus waltoni در مناطق خور زنگی، هندیجان و دلوار با استفاده از روش مولکولی RAPD، تعداد 69 نمونه گل خورک ماهی جمع آوری شد. DNA ژنومی نمونهها از بافت نرم باله ماهی به روش فنل- کلروفرم استخراج و سپس کمیت و کیفیت DNA استخراج شده با استفاده از روش اسپکتروفتومتری و الکتروفورز ژل آگارز 1 درصد تعیین شد. واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) با اس...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی ماهی گل خورک (periophthalmus waltoni) با استفاده از نشانگر های rapd در خلیج فارس
به منظور مطالعه ژنتیکی جمعیت های گل خورک ماهی periophthalmus waltoni در مناطق خور زنگی، هندیجان و دلوار با استفاده از روش مولکولی rapd، تعداد 69 نمونه گل خورک ماهی جمع آوری شد. dna ژنومی نمونه ها از بافت نرم باله ماهی به روش فنل- کلروفرم استخراج و سپس کمیت و کیفیت dna استخراج شده با استفاده از روش اسپکتروفتومتری و الکتروفورز ژل آگارز 1 درصد تعیین شد. واکنش زنجیره ای پلیمراز (pcr) با استفاده از ...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های مختلف گل محمدی شمال غرب ایران با استفاده از نشانگر RAPD
در این پژوهش نشانگر مولکولیRAPD برای تعیین تنوع ژنتیکی 12 جمعیت گل محمدی شمال غرب ایران مورد استفاده قرار گرفت. با استفاده از 22 آغازگر، تعداد 262 باند قابل تشخیص ایجاد شد که 67% آنها ( 180 باند) در بین جمعیتهای مختلف چند شکلی نشان دادند. تعداد متوسط باندها به ازای هر آغازگر 9/11 بود. شاخص تشابه Dice برای تعیین همسانیهای ژنتیکی بین جمعیتها مورد استفاده قرار گرفته و با استفاده از الگوریتم UPGMA ...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های گونه Thymus eriocalyx با استفاده از مارکر مولکولی RAPD
جنس .Thymus L یکی از بزرگترین جنس های خانواده نعنا و گیاهان آروماتیک است. گیاهان این جنس به دلیل دارا بودن اسانس های روغنی ارزش تجاری دارند. گونه Thymus eriocalyx یکی از گونه های این جنس است که انحصاری فلات ایران است. به منظور بررسی های مولکولی در افراد جمعیت های گونه Thymus eriocalyx در ایران، 10 رویشگاه در استانهای لرستان، مرکزی، همدان، کرمانشاه و کردستا...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های گل راعی (Hypericum perforatum L.) مناطق مختلف ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولی AFLP
مقدمه : گل راعی یکی از گیاهان مهم دارویی ایران است که عمدتاً در درمان افسردگی و همچنین میگرن استفاده می شود. هدف: به منظور بررسی تنوع ژنتیکی گل راعی، جمعیت های جمع آوری شده این گیاه از نقاط مختلف کشور در پژوهشکده گیاهان دارویی جهاددانشگاهی کشت و از نظر تنوع ژنتیکی و همبستگی آن با پراکنش جغرافیایی مورد بررسی قرار گرفتند. مورد EcoRI و Tru1I استخراج شد و با آنزیم های CTAB ژنومی از بافت بر گهای ج...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی درختان حرا در سواحل استان هرمزگان با استفاده از روش مولکولی RAPD
به منظور بررسی تنوع ژنتیکی درختان حرا در سواحل استان هرمزگان با استفاده از روش مولکولی RAPD تعداد 40 نمونه از برگ درختان حرا در ایستگاه های مختلف ( بنادر جاسک، خمیر، تیاب و جزیره قشم ) جمع آوری و به آزمایشگاه منتقل و پس از استخراج DNA بوسیله 30 پرایمر در واکنش زنجیره ای پلیمراز مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج کار نشان داد که بیشترین میزان میانگین تنوع ژنتیکی در جمعیت قشم 458/0 با انحراف معیار 033...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023